MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Actinosynnema mirum DSM 43827 chromosome

Total Repeats: 259223

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_013093	GAC	2	6	17988	17993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256374177
502	NC_013093	GC	3	6	18008	18013	0 %	0 %	50 %	50 %	256374177
503	NC_013093	CCCG	2	8	18041	18048	0 %	0 %	25 %	75 %	256374177
504	NC_013093	TCG	2	6	18106	18111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256374177
505	NC_013093	TGC	2	6	18112	18117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256374177
506	NC_013093	GAC	2	6	18171	18176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256374177
507	NC_013093	GAG	2	6	18195	18200	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256374177
508	NC_013093	TCG	2	6	18322	18327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256374177
509	NC_013093	CAC	2	6	18332	18337	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256374177
510	NC_013093	CCGGCC	2	12	18355	18366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256374177
511	NC_013093	TCGCGG	2	12	18406	18417	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	256374177
512	NC_013093	CGACCT	2	12	18449	18460	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	256374177
513	NC_013093	GTG	2	6	18483	18488	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256374177
514	NC_013093	TGC	2	6	18520	18525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256374177
515	NC_013093	GAA	2	6	18527	18532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256374177
516	NC_013093	CG	3	6	18558	18563	0 %	0 %	50 %	50 %	256374177
517	NC_013093	CGC	2	6	18589	18594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256374177
518	NC_013093	TGC	2	6	18634	18639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256374177
519	NC_013093	CGG	2	6	18643	18648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256374177
520	NC_013093	TCA	2	6	18655	18660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256374177
521	NC_013093	TGA	2	6	18712	18717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256374177
522	NC_013093	AGC	2	6	18751	18756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256374177
523	NC_013093	C	6	6	18813	18818	0 %	0 %	0 %	100 %	256374177
524	NC_013093	CGT	2	6	18897	18902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256374178
525	NC_013093	TGG	2	6	18905	18910	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256374178
526	NC_013093	GTG	2	6	18916	18921	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256374178
527	NC_013093	GCT	2	6	18924	18929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256374178
528	NC_013093	TCG	2	6	18935	18940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256374178
529	NC_013093	GAC	2	6	18981	18986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256374178
530	NC_013093	CAGC	2	8	19141	19148	25 %	0 %	25 %	50 %	256374179
531	NC_013093	GTG	2	6	19157	19162	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256374179
532	NC_013093	GC	3	6	19172	19177	0 %	0 %	50 %	50 %	256374179
533	NC_013093	CAG	2	6	19246	19251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256374179
534	NC_013093	GCT	2	6	19347	19352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256374179
535	NC_013093	CGCC	2	8	19509	19516	0 %	0 %	25 %	75 %	256374179
536	NC_013093	CGA	2	6	19542	19547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256374179
537	NC_013093	GTGCAG	2	12	19591	19602	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	256374179
538	NC_013093	TGCT	2	8	19670	19677	0 %	50 %	25 %	25 %	256374179
539	NC_013093	TGC	2	6	19695	19700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256374179
540	NC_013093	TCG	2	6	19703	19708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256374179
541	NC_013093	CGG	2	6	19805	19810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256374179
542	NC_013093	GGT	2	6	19876	19881	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256374179
543	NC_013093	CAG	2	6	19882	19887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256374179
544	NC_013093	TCG	2	6	19889	19894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256374179
545	NC_013093	CGT	2	6	20001	20006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256374179
546	NC_013093	CGG	2	6	20022	20027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256374179
547	NC_013093	CGT	2	6	20106	20111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256374179
548	NC_013093	TGC	2	6	20114	20119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256374179
549	NC_013093	TCC	2	6	20126	20131	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256374179
550	NC_013093	GAA	2	6	20164	20169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256374179
551	NC_013093	CCGG	2	8	20178	20185	0 %	0 %	50 %	50 %	256374179
552	NC_013093	GGT	2	6	20229	20234	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256374179
553	NC_013093	GGGC	2	8	20268	20275	0 %	0 %	75 %	25 %	256374179
554	NC_013093	CGG	2	6	20328	20333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256374179
555	NC_013093	TGG	2	6	20464	20469	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256374180
556	NC_013093	ACG	2	6	20548	20553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256374180
557	NC_013093	GGTC	2	8	20555	20562	0 %	25 %	50 %	25 %	256374180
558	NC_013093	CGG	3	9	20575	20583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256374180
559	NC_013093	CGT	2	6	20642	20647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256374180
560	NC_013093	CCA	2	6	20696	20701	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256374180
561	NC_013093	GCT	2	6	20747	20752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256374180
562	NC_013093	GGT	2	6	20768	20773	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256374180
563	NC_013093	CAC	2	6	20775	20780	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256374180
564	NC_013093	TGC	2	6	20848	20853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256374180
565	NC_013093	CGA	2	6	20867	20872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256374180
566	NC_013093	GCG	2	6	20899	20904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256374180
567	NC_013093	CGG	2	6	20978	20983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256374180
568	NC_013093	CTGG	2	8	21002	21009	0 %	25 %	50 %	25 %	256374180
569	NC_013093	GGC	2	6	21045	21050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256374180
570	NC_013093	CGG	2	6	21079	21084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256374180
571	NC_013093	CGC	2	6	21087	21092	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256374180
572	NC_013093	GCC	2	6	21168	21173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
573	NC_013093	CGG	2	6	21188	21193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
574	NC_013093	G	6	6	21205	21210	0 %	0 %	100 %	0 %	256374181
575	NC_013093	TGC	2	6	21213	21218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256374181
576	NC_013093	CCGG	2	8	21225	21232	0 %	0 %	50 %	50 %	256374181
577	NC_013093	GAC	2	6	21244	21249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256374181
578	NC_013093	CTG	2	6	21292	21297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256374181
579	NC_013093	TGG	2	6	21342	21347	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256374181
580	NC_013093	GCC	2	6	21383	21388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256374181
581	NC_013093	CG	3	6	21581	21586	0 %	0 %	50 %	50 %	256374181
582	NC_013093	TCC	2	6	21590	21595	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256374181
583	NC_013093	TGATCG	2	12	21648	21659	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	256374181
584	NC_013093	CGTGC	2	10	21679	21688	0 %	20 %	40 %	40 %	256374181
585	NC_013093	CGA	2	6	21702	21707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256374181
586	NC_013093	CGT	2	6	21831	21836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256374181
587	NC_013093	CCA	2	6	21849	21854	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256374181
588	NC_013093	CGAC	2	8	21879	21886	25 %	0 %	25 %	50 %	256374181
589	NC_013093	GCTG	2	8	21948	21955	0 %	25 %	50 %	25 %	256374181
590	NC_013093	GGCAC	2	10	21963	21972	20 %	0 %	40 %	40 %	256374181
591	NC_013093	GC	3	6	22008	22013	0 %	0 %	50 %	50 %	256374181
592	NC_013093	CG	3	6	22014	22019	0 %	0 %	50 %	50 %	256374181
593	NC_013093	CGC	2	6	22071	22076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256374181
594	NC_013093	GGA	2	6	22078	22083	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256374181
595	NC_013093	AGC	2	6	22097	22102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256374181
596	NC_013093	GGT	2	6	22105	22110	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256374181
597	NC_013093	CGCCAG	2	12	22120	22131	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	256374181
598	NC_013093	CAG	2	6	22144	22149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256374181
599	NC_013093	GAC	2	6	22150	22155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256374181
600	NC_013093	ATC	2	6	22163	22168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256374181
601	NC_013093	GC	3	6	22180	22185	0 %	0 %	50 %	50 %	256374181
602	NC_013093	CTC	3	9	22201	22209	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256374181
603	NC_013093	GCG	2	6	22214	22219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256374181
604	NC_013093	CGCTCC	2	12	22247	22258	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	256374181
605	NC_013093	ACC	2	6	22268	22273	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256374181
606	NC_013093	TGCC	2	8	22283	22290	0 %	25 %	25 %	50 %	256374181
607	NC_013093	CCG	2	6	22292	22297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256374181
608	NC_013093	TCG	2	6	22299	22304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256374181
609	NC_013093	CTG	2	6	22342	22347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256374181
610	NC_013093	CAG	2	6	22351	22356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256374181
611	NC_013093	CTC	2	6	22366	22371	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256374181
612	NC_013093	TCA	2	6	22377	22382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256374181
613	NC_013093	GC	3	6	22430	22435	0 %	0 %	50 %	50 %	256374181
614	NC_013093	CGG	2	6	22440	22445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256374181
615	NC_013093	CGA	2	6	22528	22533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256374181
616	NC_013093	CTC	2	6	22546	22551	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256374181
617	NC_013093	AGC	2	6	22613	22618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256374181
618	NC_013093	CGG	2	6	22719	22724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256374181
619	NC_013093	CGG	2	6	22734	22739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256374181
620	NC_013093	CGT	2	6	22746	22751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256374181
621	NC_013093	GC	4	8	22757	22764	0 %	0 %	50 %	50 %	256374181
622	NC_013093	ATC	2	6	22805	22810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256374181
623	NC_013093	TGCCG	2	10	22842	22851	0 %	20 %	40 %	40 %	256374181
624	NC_013093	GC	3	6	22898	22903	0 %	0 %	50 %	50 %	256374181
625	NC_013093	GTCTCG	2	12	22997	23008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256374181
626	NC_013093	CGA	2	6	23025	23030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256374181
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753	NC_013093	AGG	2	6	27842	27847	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256374184
754	NC_013093	TGG	2	6	27867	27872	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256374184
755	NC_013093	TCC	2	6	27923	27928	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256374184
756	NC_013093	GGGGA	2	10	28000	28009	20 %	0 %	80 %	0 %	256374185
757	NC_013093	GTG	3	9	28019	28027	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256374185
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765	NC_013093	CGG	2	6	28212	28217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256374185
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769	NC_013093	CGC	2	6	28353	28358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256374185
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773	NC_013093	CGG	3	9	28434	28442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256374185
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781	NC_013093	CGG	2	6	28597	28602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256374185
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872	NC_013093	TG	3	6	31442	31447	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
873	NC_013093	CGG	2	6	31469	31474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
874	NC_013093	GGTT	2	8	31477	31484	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
875	NC_013093	GTC	2	6	31499	31504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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877	NC_013093	CGC	2	6	31533	31538	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
878	NC_013093	GCA	2	6	31616	31621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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